Retour à l'accueil Notre expertise : Génomique

Maîtrisez la génomique de vos produits et procédés, pour les comprendre et les contrôler – de la conception du mode opératoire jusqu’à l’analyse des données.

Chez Smaltis, nous mettons la puissance de la génomique au service de vos projets nécessitant l’exploration et la maitrise de matériel génétique. Smaltis travaille à partir de tout type d’échantillons, du plus simple au plus complexe : produits cellulaires ou moléculaires, échantillons cliniques, prélèvements environnementaux, produits issus de process industriels, kits de diagnostic et outils de détection, ou encore équipements/réactifs d’usage en biologie moléculaire.
Nos deux pôles — Research Microbiology et Precision Microbiology — travaillent de concert pour fiabiliser vos projets en génomique, qu’il s’agisse de projets exploratoires ou de validation de produits et bioprocédés.

Réservez un appel découverte

Notre offre

Une offre variée et adaptée à vos enjeux divers

Application 1

CARACTERISATION D’ECHANTILLONS

2

Évaluation d’effet moléculaire

3

Développement de kits & réactifs

4

BIoproduction

Vos besoins

Caractérisation moléculaire d’échantillons complexes

Évaluation de l’impact de produits ou de procédés sur cibles moléculaires d’intérêt

Validation externe de réactifs, appareils ou kits de biologie moléculaire à usage recherche ou diagnostic

Contrôle de matière première, de process et de produits finis pour libération de lots

Nos réponses

Extraction d’acides nucléiques
Recherche & Quantification de biomarqueurs par qPCR ou NGS

Design du protocole d’étude
Extraction d’ARN et reverse transcription
Mesure de l’expression génique par quantification de transcrits (RT-qPCR)

Plateau de biologie moléculaire avec différentes technologies disponibles

Recherche de contamination
Etude de stabilité génétique de souches par analyses PFGE et MLST
Etude de linéarisation de plasmides par qPCR

Notre promesse : rigueur et fiabilité pour sécuriser vos résultats

Ils nous font confiance

Témoignages et références

Jérôme SCHMEISSER
Biology Lab Manager
DSM-FIRMENICH

Dans le cadre de nos développements de compléments alimentaires pour la santé animale, nous avons fait appel à SMALTIS afin d’évaluer l’impact de nos produits sur l’expression de gènes d’intérêt sur différents tissus. Les compétences de SMALTIS en biologie moléculaire nous permettent de nous reposer sur ce laboratoire, dont les résultats qualitatifs nous procurent des données robustes et fiables. Nous bénéficions également d’échanges constructifs avec leurs équipes, afin d’avancer conjointement tout au long du projet. SMALTIS constitue ainsi une véritable extension de notre département R&D, nous permettant de nous concentrer sur nos expertises propres, tout en comptant sur ce partenaire avec lequel nous allons continuer de collaborer.

Eric ROBINET
Président Fondateur
LYMPHOBANK

Spécialisés dans la production de banques cellulaires issues du sang, à destination de la recherche et des patients, nous avons, dès la mise en place de nos préparations, eu besoin de faire appel à une société spécialisée en microbiologie pour garantir l’absence de contamination de nos produits. Etablis à l’époque dans les locaux de l’EFS, c’est tout naturellement que nous nous sommes dirigés vers Smaltis, située à quelques pas de nos laboratoires. Leur approche de travail et la fiabilité de leurs résultats nous ont tout à fait convenus et c’est depuis maintenant plusieurs années que nous leur confions toutes nos analyses microbiologiques. La croissance de nos sociétés respectives nous a amenés à chercher de nouveaux locaux… et c’est avec plaisir que nous avons pris le relai dans ceux de Smaltis, qui a alors emménagé dans le bâtiment juste en face ! Il est important de compter Smaltis dans notre réseau de partenaires fiables aux valeurs communes, pour apporter notre pierre à l’édifice de la santé !

Laurence RINGENBACH
Cell Biology Lab Manager,
Immunodiagnostic Reagents,
DIACLONE SAS part of Medixbiochemica

Smaltis est un partenaire de longue date, avec qui nous avons établi une relation privilégiée. Nous travaillons dans des domaines très complémentaires, et collaborons régulièrement afin de fournir une offre complète à nos clients, grâce à des prestations en microbiologie et biologie moléculaire dont nous avons spécifiquement besoin. Nous les sollicitons ainsi pour des services d’analyse de contamination d’échantillons, de production de bactéries compétentes, ou encore de préparation de suspensions de souches inactivées pour le développement de nouveaux anticorps monoclonaux. Un véritable lien de confiance s’est mis en place, facilité par une proximité géographique de nos locaux respectifs et un dialogue aisé avec leurs équipes, dont la flexibilité, la ténacité à résoudre les problèmes et la qualité de travail sont essentielles pour nous.

Pascal MERTENS
R&D Director
CORIS BIOCONCEPT

Dans le cadre du développement d’outils de diagnostic rapide in vitro (IVD) pour détecter des pathologies infectieuses chez l’humain, nous avions besoin d’évaluer la performance de nouveaux tests dédiés à la détection de mécanismes d’antibiorésistance bactérienne. Nous avons interrogé Smaltis, une société spécialisée en microbiologie et biologie moléculaire, qui fut tout à fait apte à répondre à notre objectif. Smaltis a pu en effet mettre à disposition son expertise pour évaluer l’efficacité et la robustesse de nos tests sur des souches cliniques présentant des profils d’antibiorésistance bien spécifiques, comparativement à une méthode de biologie moléculaire. Les résultats apportés nous ont permis de confirmer la sensibilité, la spécificité et la précision de notre test, et de satisfaire aux exigences réglementaires. Le laboratoire Smaltis est pour nous un acteur expert sur lequel nous pouvons compter pour accompagner nos développements et obtenir les données indispensables à la mise sur le marché de nos outils.

Actualités et articles

Gestion de la contamination microbiologique : identifier, comprendre et prévenir la récidive

Une contamination microbiologique ne se limite pas à un résultat non conforme. Dans un développement R&D, un contrôle qualité, un procédé industriel ou une production biologique, elle pose immédiatement des questions concrètes : d’où vient le contaminant, est-il ponctuel ou récurrent, quel est son impact, et comment éviter qu’il ne réapparaisse ?

La réponse ne consiste pas seulement à identifier la bactérie puis à relancer le procédé. Pour maîtriser durablement une contamination bactérienne, il faut construire une investigation capable de relier les observations de laboratoire au contexte réel : échantillons, flux, matières premières, équipements, nettoyage, désinfection et pratiques de terrain.

Chez Smaltis, nous abordons ces situations comme une enquête microbiologique structurée : comprendre le problème, isoler les contaminants, identifier et comparer les isolats, conserver les éléments utiles, puis tester les solutions de prévention adaptées.

LIRE L'ARTICLE

Microbiote cutané : cultiver l’exigence pour objectiver l’innovation

Le microbiote cutané n’est pas un décor. C’est une composante fonctionnelle de la peau, impliquée dans la protection contre les pathogènes, le dialogue immunitaire et la modulation de l’inflammation. Un écosystème dynamique, fait d’interactions fines entre bactéries, levures, hôte et environnement.

Notre approche repose sur une conviction simple : comprendre un microbiote, ce n’est pas seulement l’identifier. C’est savoir le cultiver, l’interroger et produire une donnée scientifiquement défendable.

C’est précisément ainsi que nous abordons le microbiote cutané : comme un écosystème complexe, dont il faut maîtriser les acteurs, les dynamiques et les mécanismes avant de prétendre en moduler l’équilibre.

LIRE L'ARTICLE

L’histoire d’un microbiote qui devint médicament

Il était une fois, dans les hôpitaux du XXIe siècle, une infection que même les antibiotiques ne parvenaient plus à faire taire. Une infection opportuniste, causée par une bactérie nommée Clostridioides difficile, qui surgissait souvent chez des patients déjà fragilisés… et surtout déjà lourdement traités. Revenons sur l’histoire de cette infection à l’origine de nouveaux traitements.

LIRE L'ARTICLE

Caractérisation des probiotiques : démontrer la sécurité et objectiver l’activité

Les probiotiques sont souvent présentés comme une catégorie simple. En réalité, leur caractérisation est devenue un exercice scientifique et réglementaire exigeant. Il ne suffit plus d’identifier une espèce ni d’invoquer un historique d’usage favorable : la démonstration doit désormais être conduite au niveau de la souche, en cohérence avec l’usage visé, la population cible et le cadre réglementaire considéré. Dans les référentiels de référence, un micro-organisme ne peut être qualifié de probiotique au sens strict que s’il est suffisamment caractérisé, sûr pour l’usage prévu, vivant à dose pertinente jusqu’à la fin de vie du produit, et associé à un bénéfice santé documenté. [1,5,7,8]

La question qui se pose alors est « que savons-nous démontrer, de façon robuste, sur son identité, sa sécurité et son activité fonctionnelle ? ». C’est particulièrement vrai pour les souches nouvelles ou peu documentées, pour lesquelles la seule taxonomie est insuffisante. Les cadres EFSA, GRAS et canadiens convergent sur un point central : la caractérisation utile est une caractérisation par souche, interprétée à la lumière de l’usage final. [1–6]

LIRE L'ARTICLE

Construction de mutants bactériens : concevoir des souches propres, robustes et exploitables

La construction de mutants bactériens est un levier central en microbiologie. Longtemps utilisée pour élucider la fonction des gènes, elle occupe aujourd’hui une place tout aussi stratégique dans des projets de bioproduction, de biotechnologie ou de développement de bactéries thérapeutiques, où la souche modifiée peut devenir le produit final.

Cette évolution change profondément la manière d’aborder la mutagénèse. Il ne s’agit plus seulement de modifier un gène, mais de concevoir une souche cohérente avec son usage final, ses contraintes d’exploitation et son niveau d’exigence réglementaire.

LIRE L'ARTICLE

La lugdunine, ou l’arme secrète d’une irréductible bactérie

Il était une fois une bataille invisible, menée au plus profond de notre nez. Un champ de guerre microscopique, où des bactéries s’affrontent sans relâche pour défendre leur territoire. Un peu comme un village d’irréductibles Gaulois, encerclé de toutes parts… sauf qu’ici, pas de Romains, mais des microbes. C’est dans ce décor étonnamment stratégique qu’un antibiotique inattendu a été découvert : la lugdunine.

LIRE L'ARTICLE

2026 : relever de nouveaux défis scientifiques à vos côtés

Alors que 2026 s’ouvre devant nous, toute l’équipe Smaltis vous adresse ses vœux les plus sincères : que cette nouvelle année soit riche en clarté, en créativité, en collaborations stimulantes… et en avancées scientifiques qui trouvent l’écho qu’elles méritent.

LIRE L'ARTICLE

Tests d’activité antimicrobienne : objectiver, comprendre et anticiper la résistance

Chaque jour, les antimicrobiens affrontent leurs adversaires naturels : les bactéries.
Mais dans cette guerre silencieuse, rien n’est figé : les bactéries apprennent, s’adaptent, se défendent… et développent des mécanismes de résistance toujours plus sophistiqués.
Smaltis est une CRO de microbiologie spécialisée dans l’étude de l’antibiorésistance et l’accompagnement du développement préclinique d’antimicrobiens. Nous soutenons les développeurs de nouveaux antibiotiques, peptides, biocides et autres agents anti-infectieux avec une palette complète de tests in vitro, conçus pour répondre aux projets R&D les plus ambitieux.

LIRE L'ARTICLE

À la rencontre des acteurs de l’innovation

Présence sur les salons phares de l’automne 2025 ! Des dispositifs médicaux aux biothérapies, de la recherche fondamentale à la production industrielle, Smaltis va à la rencontre des porteurs de projets pour mieux comprendre les besoins en microbiologie et construire de nouvelles collaborations.

LIRE L'ARTICLE

Nouvelle structuration de l’offre : 2 Business Units au service de vos projets

Chez Smaltis, notre ambition reste inchangée : mettre l’excellence microbiologique au service de vos innovations. Pour mieux répondre à la diversité de vos besoins, nous avons structuré notre offre autour de 2 Business Units complémentaires, véritables piliers de notre engagement scientifique et technique.

LIRE L'ARTICLE

étudions votre projet !

Nos services vous intéressent ? Nos experts sont à votre écoute pour étudier vos besoins et concevoir avec vous une collaboration sur-mesure.

Réservez un appel découverte